Njen predsednik Darko Štrajn je v sporočilu za javnost zapisal, da razveljavljena sodba zahteva nedvoumno javno obsodbo nespodobnih političnih poskusov rehabilitacije vojnih zločincev, pri tem pa ugotavlja, da smo "trenutno v državi kvečjemu priča prav nasprotnim tendencam".
V akademiji pričakujejo, da se bosta predsednik države Borut Pahor in predsednik vlade Marjan Šarec "kot najbolj izpostavljena predstavnika politične oblasti jasno opredelila do naših skupnih vrednot in zgodovinskih resnic v situaciji, ko se te v časih ekspanzije političnih laži in alternativnih političnih faktografij zdijo ogrožene, kajti doslej tega nista storila". Dodaja, da od njiju pogrešajo sporočilo, ki je "lahko samo eno": "Ne glede na sodne postopke v primeru Rupnika nič ne more izbrisati njegovega vsega prezira vrednega zavezništva z okupatorjem, promocije domobranstva in končno veleizdaje slovenskega naroda."